我國公立醫院藥品銷售量占全國藥品市場銷售的大半壁河山，藥品生產和流通在市場調節下，營銷者要擠進行政化管理的公立醫院藥品流通渠道，普遍采用先貨后款（即代銷）、價格回扣、給付傭金等手段公關促銷。為了適應公立醫院藥品流通渠道需要，藥品價格差價不斷膨脹，最終，患者承受了離奇虛高的藥價。這既不是計劃經濟又不是市場經濟，是不公平的極端落后的經濟。
這一機制是“看病貴”的根源所在，它給我國醫藥經濟、醫療事業和社會帶來極大危害，造成社會不公，醫患矛盾頻發，制約了我國醫療和醫藥事業的發展。同時阻礙了醫改的深入進行。目前試行的公立醫院藥品價格零差率辦法，不能觸及事物的本質。國家應重視公立醫院藥品流通的行政化配置機制與藥品生產及流通的市場化配置機制的不匹配的矛盾。
應該建立與生產和流通相匹配的機制，實行有限度的可調控的市場配置機制。
醫院藥房是公立醫院藥品流通渠道的載體，可進行有限度的改革。公立大醫院藥房股份化是一條捷徑，由醫院控股，鼓勵強強聯合，產銷見面，引進有實力的藥品生產企業組成實體，賦予其獨立的法人資格，控制一定幅度的加價率，自負盈虧，成為藥品購銷的法人主體。藥品價格虛高的水份將通過競爭逐漸被甩干。從而抑制藥品價格環環回扣，層層加碼的時弊，克服藥品價格既不反映生產成本又不反映供求的不公平現狀。若個別緊缺藥品進入市場后，有可能比目前虛高的藥品價格還要高,國家可進一步采取宏觀調控措施，抑制價格上漲。
可以預見，破出公立醫院藥品流通的極不公平的配置機制后，通過有限的市場競爭，公立醫院藥品價格將會有明顯的下降。以媒體報道的齊藥二廠生產的亮菌甲素注射液為列，醫院售價為46.1元，出廠不足5元，其總差價率為89.2%，假設藥品正常市場流通環節保持25%平均差價率，醫院藥房公司保持15%——20%的平均差價率，藥品從藥廠到患者手中，總差價率不到50%，那么通過競爭現行藥品價格可能會大幅度下降。
通過這一小步改革，可讓患者、醫院、藥廠三者得利，政府的醫改資金投入也可發揮更大的作用，我國的醫改進程也能更加順暢。