據中國之聲《新聞縱橫》報道，1月21日，一場嘴仗引發的官司正式進入司法程序，方舟子狀告崔永元侵犯名譽權并索賠精神損失費30萬元一案由海淀法院正式受理。對于中國網民來說，"方舟子打嘴仗"，這不算什么新聞，他穩坐論戰一方，任由他的對手一茬接一茬的換：炮轟樂嘉、對戰周立波、PK羅永浩、揭露韓寒、質疑林志穎、還論戰王菲，直至現在，因轉基因技術問題，對手更新為崔永元。

　　旁觀者眼中，過去一年，方舟子還是那個方舟子，頻頻出手，不依不饒。而對于當事者而言，這一年，他過得究竟如何？從"打假斗士"到立挺轉基因的"挺轉斗士"，他又如何給自己定位？中國之聲記者就此獨家對話方舟子。

　　下午兩點，北京城西的一個舊小區，方舟子坐下回答第一個問題，就主動說到了崔永元。

　　方舟子：今天剛剛寫了一篇關于崔永元公益基金的問題，發到博客上面……

　　去年9月，在一場轉基因玉米試吃活動中，方舟子說了一句事后被廣為轉載的話："應當創造條件讓國人可以天天吃轉基因食品"，崔永元很快加入了反對者的行列。小半年了，看熱鬧的人換了幾茬，嘴仗打著打著，下手越來越重，成了官司。今年1月，方舟子正式起訴崔永元侵害其名譽，索賠30萬，要求其刪除涉嫌侵權的微博并登報道歉。

　　方舟子：這次實在是太過分了，直接就說我騙錢在美國買房什么的。一開始還算是學術之爭吧，因為他要來爭論說轉基因的安全，或者是爭論美國人吃不吃，這個還算是個學術之爭。但是他爭不下去，因為他根據的那些材料都是虛假的，他又不懂行，到最后就變成了已經不是要來跟我爭轉基因的問題了，而是要來把我打倒了。

　　相比有著生物化學博士學科背景的方舟子，崔永元的確算不上"懂行"。或許正因為此，去年底崔永元兩度自費赴美國進行轉基因技術應用的調查。他這樣表述自己的調查結果，"美國人不是放心地吃了17年轉基因，而是稀里糊涂地吃了17年轉基因。"

　　崔永元：第一次去的時候，前前后后大概見了30個人，都是什么朋友啊，都是認識的這些人，至少有25個都不知道轉基因的事，都不知道。我粗略地說，至少我們采訪的這些人、見到的這些人，除了有目標的采訪，一半以上還是不知道轉基因的事情。他不是說不知道轉基因是一個什么技術，或者說他用于食品安全不安全，是對這三個字的陌生，就沒聽說過這件事。所以我的結論是，美國人稀里糊涂地吃了17年。

　　對此，方舟子又一次表示反對。

　　方舟子：包括美國食品藥品監督管理局，在這方面所有的資料都公布了，并沒有說偷偷摸摸的，想了解的人都能夠知道的。而且實際上現在大部分的美國人都知道這事，美國兩個很大的州，一個是加州，還有一個是華盛頓州，都搞過全民公投，表決要不要對轉基因食品做標識的，所以該知道的人早都知道了。

　　方舟子和崔永元算是故人。早在2001年，人在美國的方舟子接到崔永元所在《實話實說》欄目邀請，到北京錄制一期關于納米產品的節目。據方舟子說，由于自己表現"太猛"，這期節目最終未能播出。但在當時，他對崔永元印象不錯。

　　方舟子：我那個時候當然跟他沒有什么直接的接觸，只是做節目而已，但是對他這個人的印象還不錯。

　　我看青山多嫵媚，料崔永元看我應如是。

　　崔永元：包括學術打假、包括一些人的學歷造假，方舟子勇于站出來，不代表什么利益集團，所以那個時候我對他是非常佩服的。

　　2013年，轉基因二字在中國乃至世界掀起轟轟烈烈的全民辯論；2013年，一個生物學名詞，一個著名主持人的名字，成為大多數人對方舟子印象的一部分。