“向陽紅０９”船搭載“蛟龍”號載人潛水器１３日凌晨抵達南海冷泉作業區，作業區風浪較大，而且海況將更加惡劣，當日上午航次隊員抓緊進行了一些設備的測試，試驗性應用航次潛器的第一次下潛時間還要依據海況確定。
“蛟龍”號首個試驗性應用航次原計劃第一個作業區是在海山區，但預報顯示該海域海況將非常惡劣。因此，航次現場指揮部１２日下午在氣象商討會上決定，先去海況較好的冷泉區，乘大風來臨之前進行一些設備的測試，為下潛做好準備，潛水器的具體下潛時間要根據海況確定。
“向陽紅０９”船１２日下午進入臺灣海峽，１２日夜間風力達到６級至７級，浪高２.５米以上，船舶搖晃嚴重。夜間，航次隊員對潛水器和設備進行了多次加固。
１３日凌晨，“向陽紅０９”船抵達冷泉作業區，這里的海況比航渡海域海況稍好一些，風力５級左右，船舶搖晃程度也比夜間輕了很多。凌晨５時３０分，航次隊員就開始進行溫鹽深儀等常規調查設備的安裝和測試，隨后他們還將進行潛器定位系統信標的測試。
航次現場總指揮劉峰說：“海上作業要依據氣象和海況而定，無法按照一個非常精確的時間表來執行。現在我們能做的就是趁惡劣海況來臨之前抓緊做一些準備工作，當海況達到下潛條件時保證設備和人員都準備就緒，迅速投入下潛作業。”
“蛟龍”號首個試驗性應用航次于６月１０日起航，共分為３個航段，第一航段在南海開展定位系統試驗，同時兼顧“南海深部科學計劃”開展科學研究，包括對海底生態系統、生物和地形等進行調查；第二和第三航段分別在東北太平洋中國多金屬結核勘探合同區和西北太平洋富鈷結殼勘探申請區開展近底生物調查、地質取樣、海底攝像和海底沉積物劑量反應試驗等，總計需要１１３天。