后來，汪德熙因工作需要離開根據地到昆明去，張方全面負責炸藥廠的工作。張方把研制炸藥的經驗寫成書面材料，散發到各抗日根據地。
八路軍搞到一批氯酸鉀，著手試制炸藥，但是用的是傳統的翻曬方式，在屋頂上干燥，曾出現過連人帶屋頂都炸飛的事故。在當時的條件下，防止炸藥自爆成了難題。熊大縝多次潛回到天津，請教老師葉企孫。葉企孫不顧身體不好，非要親自到冀中根據地了解情況，由于弟子們的再三勸阻才沒有成行。葉企孫對根據地造地雷的事放心不下，他馬上讓自己的實驗員閻裕昌前往冀中。閻裕昌化名門本忠，秘密進入冀中抗日根據地。
由于多年的教學實驗，門本忠對炸藥有豐富的知識。門本忠一到根據地，就解決了炸藥自爆問題，還設計出根據地特定條件下可以生產的電雷管電路。
這時，葉企孫又派學生從天津沖破日軍封鎖線運來電表、白金絲等必要物資。熊大縝等人也弄到了大批制造炸藥所需的化學原料、銅殼和鉑絲以及控制電雷管的電動起爆器。
有了地雷，冀中軍民如虎添翼。地道戰、地雷戰、伏擊戰等神奇的戰法，打得日軍日夜不寧、心驚膽戰。
地雷戰功臣熊大縝的命運悲劇
可是，就在冀中地雷戰開展得有聲有色時，大禍降臨到科學家們的頭上了。
當時是國共合作，共同抗日。1938年秋，國民政府河北省主席鹿鐘麟下令要呂正操讓出冀中，向冀東發展。這樣的要求呂正操當然不能接受，國共兩支抗日武裝面臨的是摩擦甚至火拼。熊大縝表示應該求同存異，一致對敵，避免摩擦，這引起了一些政治嗅覺靈敏者的嚴重關注。加上他多次化裝到敵占區采購軍火，更引起一些人的懷疑。
1939年1月，鹿鐘麟派一個考察團到冀中。有個叫方平的團員到供給部。熊大縝見方平是讀書人，使試著用英語與之交談。方平說得一口流利的英語，雙方一下子交流順暢起來，他們越聊越投機。供給部政委王文波在一旁聽不懂，又氣又惱，將這事當成特務嫌疑上報。
1939年春天，共產黨在各個根據地都成立了鋤奸部，發起了一個旨在清洗漢奸、特務的鋤奸運動。冀中軍區也成立了鋤奸部，抓捕了熊大縝、門本忠、張方等技研社全部技術員，接著又把供給部、炸藥廠、印刷所、衛生部、醫院、電臺、銀行、學校、報社、商店等部門中平津來的所有知識分子通通抓了起來，總共有100多人，搞出了一起轟動一時的大特務漢奸案。
“首惡”自然是熊大縝，主要罪證則是一封密信。密信是從天津送到冀中軍區供給部的一批TNT炸藥里夾帶的。內容是：“你派來的人我們已經見了，你們需要的東西，已送了幾批。急需的物資，最好在秋收之前，由河運較方便。”信尾署名是：“天津黨政軍聯合辦事處”，鋤奸部認為這是國民黨在天津的特務機關。白紙黑字，鐵證如山。而后來的調查證明，事實上它是一個國共合作的統戰組織。當時是國共合作，這個組織幫助八路軍，為抗日根據地運送炸藥。這樣一封密信卻被當成了罪證！
當過東北軍將領的呂正操司令員也在鋤奸人員的懷疑之中，他明知被抓的是一群滿腔熱血、舍身為國的愛國者，卻無力營救。
冀中抗日根據地一下子抓了這么多知識分子，遠在延安的黨中央震驚了，黨中央派彭真和許建國等人到冀中復審。復審最后的結論是：逼供不足為憑，鋤奸擴大化應予糾正。除熊大縝尚需進一步審查外，其余人員全部釋放。
1939年夏天，日軍對冀中根據地發起了更為瘋狂的大“掃蕩”，軍區主力轉移。審訊時被拷打受傷的熊大縝無法跟上隊伍，鋤奸部一名負責押解犯人的戰士喝道：“磨蹭什么？想逃跑啊？”
熊大縝說：“別那么兇，好不好！”