直到袁世凱的“小站練兵”后，那些軍校畢業(yè)生才開始得到重用。當(dāng)時(shí)袁世凱請(qǐng)當(dāng)時(shí)任天津武備學(xué)堂總辦的蔭昌推薦人才，蔭昌很自然的便想到了段祺瑞，并將他推薦到袁世凱的門下。袁世凱的新建陸軍是一支擁有步兵、騎兵、炮兵、工程兵等多兵種的新式部隊(duì)，其中炮兵就有近兩千人，段祺瑞隨后被委任為炮隊(duì)統(tǒng)帶，并得到袁世凱的極大重視。當(dāng)時(shí)段祺瑞帶的這支炮隊(duì)有速射炮、重炮等六十門，戰(zhàn)馬近五百匹，這也是中國近代歷史上第一支正規(guī)化的炮兵部隊(duì)，段祺瑞也可以說的中國第一任炮兵司令
隨著袁世凱的不斷升遷，段祺瑞也跟著沾光，陸續(xù)做到了北洋六鎮(zhèn)的統(tǒng)制之職。在清朝覆滅后，段祺瑞做過幾任陸軍總長(zhǎng)，后來因?yàn)榉磳?duì)袁世凱稱帝而隱居西山。袁世凱死前，命人將段祺瑞找來并將國事托付給他，段祺瑞也由此做上了民國的內(nèi)閣總理，成為當(dāng)時(shí)最重要的政治人物。
段祺瑞的為人一向古板嚴(yán)肅，不茍言笑，給人的印象是不太好打交道。他平時(shí)的生活也是很有規(guī)律，一年三百六十五天基本沒有什么變化。一般情況下，他都是在家吃早飯，隨后上書房看公事；看完公事后去衙門，中午再回來吃飯。
吃過中飯后，老段一般會(huì)在內(nèi)客廳睡個(gè)中覺，然后有客的時(shí)候會(huì)客，無客的時(shí)候就與棋手們下下圍棋（后來加入日本籍的國手吳清源，他小的時(shí)候便經(jīng)常陪老段下棋，老段會(huì)給棋手們每月開工資），或者找一些詩人搞搞詩會(huì)，當(dāng)時(shí)王揖唐、梁鴻志等人便是段府的常客。晚飯之后，老段照例要打一會(huì)牌（麻將）。
段祺瑞非常喜歡下圍棋，當(dāng)時(shí)他還特意養(yǎng)了一批棋手，每月發(fā)給工資，以陪他下棋。據(jù)說，那些棋手和段祺瑞下棋時(shí)都十分識(shí)相，既不能贏段祺瑞，因?yàn)槔隙巫宰鹦暮軓?qiáng)，輸了他會(huì)很不高興；但也不能多輸，因?yàn)槎噍數(shù)脑挘瑫?huì)讓段祺瑞看不起。
據(jù)稱，有一次段祺瑞和兒子段宏業(yè)下棋，棋到終盤，段祺瑞大負(fù)，氣得他跳起腳來，把棋盤掀翻，并怒斥段宏業(yè)道：“你這小子，一無所能，就知道玩這個(gè)，你以后有什么出息？”段宏業(yè)被斥后，只得諾諾而退（想必兒子輸給了他，段祺瑞又會(huì)笑罵：“你這小子，連個(gè)棋都下不好，你以后還能干什么？”）。段宏業(yè)是到段祺瑞的大兒子，平時(shí)最喜歡吃喝玩樂，素?zé)o大志，他在外面一向是花天酒地，唯獨(dú)見了老段就像是老鼠見了貓，大氣也不敢出一聲，這不，贏了棋還被老段斥責(zé)一頓，他屁也不敢放一個(gè)。
唯獨(dú)有個(gè)小棋手卻不畏懼段祺瑞，這就是后來成為著名棋手的吳清源。吳清源做段府的棋手時(shí)年紀(jì)還小，也最受段祺瑞的喜愛。他在和老段下棋的時(shí)候到是毫不客氣，倆人經(jīng)常能下個(gè)旗鼓相當(dāng)，但隨著吳清源水平的不斷提高，段祺瑞和他對(duì)弈往往輸多贏少，后來也就不再和他下了。吳清源后來入了日本籍，成為日本圍棋界的一流高手。
段祺瑞脾氣大，治家嚴(yán)，手下的人都戰(zhàn)戰(zhàn)兢兢，不敢犯錯(cuò)，特別是不敢向來賓索取門包。按前清的規(guī)矩，一般大官的門房都有一個(gè)陋規(guī)，那就是收取門包，否則就進(jìn)不了門。段祺瑞大概吃過這個(gè)“門包”的虧，因而最恨別人收門包，他要是聽說誰收門包，還真能把人拉出去槍斃嘍。
按中國人的習(xí)慣，過年過節(jié)的，終究要禮尚往來，而地方上的官員來京辦事，也一般會(huì)給重要的京官送點(diǎn)禮，這個(gè)規(guī)矩，唯獨(dú)到了老段這里行不通。每逢有人將禮物送到段公館，門房都是將之放在內(nèi)客廳門口的條案上，等段祺瑞親自過目后定奪。段祺瑞每次路過時(shí)，總是仔細(xì)的看了又看，最后挑一兩件最不值錢的留下，其余的全部讓人送回。
有一次，江蘇督軍齊燮元給段祺瑞送了一個(gè)精美絕倫的圍屏，圍屏上鑲有各種寶石，五顏六色，非常漂亮。段家的人喜歡得不得了，晚上還偷偷的起來觀看。但第二天早上，段祺瑞便令人送回。張作霖有一次給段祺瑞送了一些東北的特產(chǎn)，如江魚、黃羊等，在其副官的一再懇求下，段祺瑞才手下兩條江魚，這已經(jīng)是非常大的面子了。唯獨(dú)有一次馮玉祥給他送了一個(gè)大南瓜，老段倒是很中意，沒有送回。